RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Npr1P18293 1057 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccnd2P30280 289 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc7a1Q09143 622 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Samd7Q8C8Y5 445 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nudt8Q9CR24 210 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gins2Q9D600 185 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa23.45■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm13084A2A8N0 494 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r121A2BE32 847 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Heatr4E9Q357 955 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 P01734 135 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AladP10518 330 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sdc2P43407 202 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrkcbP68404 671 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ric8aQ3TIR3 530 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itpripl2Q3UV16 535 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Osbpl6Q8BXR9 959 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Castor2Q8CAB8 329 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sfxn1Q99JR1 322 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lgals2Q9CQW5 130 aa23.44■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cntnap5aQ0V8T9 1304 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r79E9Q067 851 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif3dO70194 548 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnj4P52189 445 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acot10Q32MW3 439 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd180Q62192 661 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrsam1Q80ZI6 727 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atat1Q8K341 421 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eps8l1Q8R5F8 716 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Med15Q924H2 789 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fzd5Q9EQD0 585 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tacc2Q9JJG0 1149 aa23.43■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vwa8Q8CC88 1905 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clca3bE9PUL3 1044 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spryd3E9Q9B3 442 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn1r86L7N213 316 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tnfrsf4P47741 272 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcmtd1P59913 357 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc26a2Q62273 739 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HyiQ8R1F5 277 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr345Q8VGK4 311 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp4f13Q99N19 523 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ribc1Q9D0B8 379 aa23.42■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aldh1a7O35945 501 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Man1a2P39098 641 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam193bQ3U2K0 892 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp791Q497V9 528 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Foxn3Q499D0 457 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wdr18Q4VBE8 431 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sycp1Q62209 993 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc38Q8CDN8 563 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tubgcp2Q921G8 905 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MbipQ99LQ1 341 aa23.41■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3285A0A1W2P7U0 201 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mctp1E9PV86 951 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 JundP15066 341 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Uba1yP31254 1058 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ntsr2P70310 416 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mysm1Q69Z66 819 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp37Q8C0R0 979 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp623Q9CY99 499 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc22a17Q9D9E0 401 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tex21Q9R0U9 575 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dock1Q8BUR4 1865 aa23.4■■□□□ 1.34
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3002E9PW72 216 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm21973F6WEZ7 68 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf354cQ571J5 560 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wee2Q66JT0 555 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem161bQ8C2L6 487 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubxn4Q8VCH8 506 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olig1Q9JKN5 260 aa23.39■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ralgps1A2AR50 585 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcb4P21440 1276 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Folr1P35846 255 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd37Q61470 281 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp3a11Q64459 504 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrfn2Q80TG9 788 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Qsox1Q8BND5 748 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tcaf1Q8BNE1 924 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CptpQ8BS40 216 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fndc3aQ8BX90 1198 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc41a2Q8BYR8 573 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcdhb18Q91Y02 792 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Efhd1Q9D4J1 240 aa23.38■■□□□ 1.33
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Serpinb12Q9D7P9 423 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms