RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q ILM1P47155 203 aa0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q ARO8P53090 500 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q PNC1P53184 216 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR212W-AP0CX91 67 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q FCY2P17064 533 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR063CP38083 404 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR209WP38311 105 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q OSW5P40219 148 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q KAP114P53067 1004 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL046WP53956 172 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q ABF2Q02486 183 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q CWC27Q02770 301 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR098CQ06089 161 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q PSF1Q12488 208 aa0.08□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL40P36534 297 aa0.07□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR286CQ05530 114 aa0.07□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP16Q12497 93 aa0.07□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPS28P21771 286 aa0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SGE1P33335 543 aa0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q UMP1P38293 148 aa0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRS2P38620 318 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q GOS1P38736 223 aa0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q KNH1P50112 268 aa0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNZ2P53824 298 aa0.06□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPM1P17536 199 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q ERD2P18414 219 aa0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q HOM6P31116 359 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q OPY1P38271 328 aa0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SMB1P40018 196 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q OST6Q03723 332 aa0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR029WQ12243 111 aa0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q UGX2P32772 223 aa0.04□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q DID2P69771 204 aa0.04□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAS3Q03655 524 aa0.04□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRM12Q04235 462 aa0.04□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDY2Q12285 212 aa0.04□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q PDR18P53756 1333 aa0.04□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q STP22P25604 385 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNC2P33328 115 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q CAT5P41735 233 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNR077CP53758 84 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL247WP53852 767 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL010WP53981 241 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YML108WQ03759 105 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YML096WQ04489 525 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR007C-AQ07074 71 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q FSF1Q12029 327 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q REX3Q12090 404 aa0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
tW(UCA)QtW(UCA)Q REP2P03872 296 aa0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data0.02□□□□□ -2.41not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q YEA4P40004 342 aa0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRP1P10662 321 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR096WP38256 230 aa0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEI1Q06058 285 aa0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG40Q99325 256 aa0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q COX2P00410 251 aa0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS5P26783 225 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR127WP38833 243 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q USE1P53146 245 aa0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR209CQ03480 137 aa0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADH6Q04894 360 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP49A0A023PZB3 126 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET100P38958 111 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q EGD1Q02642 157 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMD8Q03697 442 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR248CQ03786 193 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR413WQ06689 675 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q CSM4Q08955 156 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPM2Q12008 311 aa-0.01□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q STF1P01098 86 aa-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC11P15367 167 aa-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAL82P21705 255 aa-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPT5P33297 434 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRX1P34227 261 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.02□□□□□ -2.41not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q HYR1P40581 163 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAR1P46683 200 aa-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLG2P47011 380 aa-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q RHO3Q00245 231 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q TSC3Q3E790 80 aa-0.02□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q TUS1Q06412 1307 aa-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR236CA0A023PZG4 107 aa-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL24AP04449 155 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC36P06100 191 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL075CP36083 450 aa-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIB1P38066 345 aa-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q IRC22P40006 225 aa-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR144WP40214 342 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q SWP1Q02795 286 aa-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR170W-BP0C5R9 85 aa-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q KRR1P25586 316 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRPL28P36527 147 aa-0.04□□□□□ -2.42
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