RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C MSS2P40990 351 aa5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C RPA43P46669 326 aa5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C PUS4P48567 403 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C SKP1P52286 194 aa5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YNL234WP53857 426 aa5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C FCY1Q12178 158 aa5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YLR099W-AQ3E798 87 aa5.58□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C CDC31P06704 161 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C RFA3P26755 122 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C ERG2P32352 222 aa5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C SWD3P38123 315 aa5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C PRM5P40476 318 aa5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YLR122CQ12312 125 aa5.57□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C SMB1P40018 196 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C BNA6P43619 295 aa5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YIP1P53039 248 aa5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C DOC1P53068 250 aa5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C FIT1Q04433 528 aa5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C DGK1Q12382 290 aa5.56□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YCR061WP25639 631 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C MTC7P32633 139 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C VAM7P32912 316 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C AVT6P40074 448 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C SYS1P41544 203 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YGR151CP53287 111 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C MRPL13Q02204 264 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C CTF19Q02732 369 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C HOF1Q05080 669 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C TFC7Q12415 435 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YOR192C-CQ3E736 78 aa5.55□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C GCN4P03069 281 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C RNA14P25298 677 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C OCH1P31755 480 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YBL010CP32788 280 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C VPS55P47111 140 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C BXI1P48558 297 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YDL086WQ07505 273 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C RBD2Q12270 262 aa5.54□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C IFM1P25038 676 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C ERG3P32353 365 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C RAD23P32628 398 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data5.53□□□□□ -1.52not detected
SPE3YPR069C GPI14P47088 403 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C DIE2P50076 525 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C DUO1P53168 247 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C IMO32P53219 342 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C RCF1Q03713 159 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C HOR7Q05827 59 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C MDM36Q06820 579 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C YPD1Q07688 167 aa5.53□□□□□ -1.52
SPE3YPR069C MET17P06106 444 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YHR212W-AP0CX91 67 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C FUS3P16892 353 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C VMA5P31412 392 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YBR144CP34215 104 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C UTP30P36144 274 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C FLO5P38894 1075 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C SOL1P50278 321 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C BUD25P85052 153 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C MAK3Q03503 176 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YOL118CQ08259 102 aa5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C HIS3P06633 220 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C CHO1P08456 276 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YLL053CP0CD98 152 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RFA1P22336 621 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C AGA2P32781 87 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C REC104P33323 182 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C RPB7P34087 171 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C GOS1P38736 223 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YJL213WP40896 331 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C WWM1P43582 211 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C GRX3Q03835 250 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YMR130WQ04223 302 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C JID1Q12350 301 aa5.51□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C AAC1P04710 309 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C OLE1P21147 510 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C MRP20P32387 263 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YUH1P35127 236 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YKL075CP36083 450 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YHK8P38776 514 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C PCL6P40038 420 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C BMT5P40493 336 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C FMP48P53233 369 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YML122CQ03207 126 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C YDR286CQ05530 114 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C PRM3Q08931 133 aa5.5□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C URA3P03962 267 aa5.49□□□□□ -1.53
SPE3YPR069C PET54P10834 293 aa5.49□□□□□ -1.53
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