RNA–Protein interactions for RNA: YPL194W

DDC1, Transcript of DNA damage checkpoint protein, yeast

Gene DDC1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDC1	YPL194W	YNL046W	P53956	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ODC1	Q03028	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ATG39	Q06159	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	EDE1	P34216	1381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SSK2	P53599	1579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	CTS1	P29029	562 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SER2	P42941	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	CRZ1	P53968	678 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	IRC15	Q02733	499 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PHO2	P07269	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MSI1	P13712	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	TRS65	P32893	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YKL102C	P34249	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SOL2	P37262	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YHL049C	P38722	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PAN6	P40459	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MNN5	P46982	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	HHT1	P61830	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	TMA23	Q03525	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SNF4	P12904	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	ATG15	P25641	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MRPL39	P36533	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RPA43	P46669	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SNO2	P53823	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SLM2	P53955	656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SDC1	Q03323	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MCH1	Q07376	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MSA1	Q08471	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	IES4	Q08561	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	DRS2	P39524	1355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PCL1	P24867	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	CNB1	P25296	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YHL044W	P38727	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	GWT1	P47026	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	DGA1	Q08650	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	OSW1	Q08692	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PRY2	P36110	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	LEU5	P38702	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	AIM18	P38884	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	AIM2	P39721	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	OST2	P46964	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MRH4	P53166	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PRR2	Q12310	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SIR2	P06700	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PHO85	P17157	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	STP22	P25604	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	TRS20	P38334	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	NHP10	Q03435	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	PFA4	Q12006	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	BI2	P03873	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SNC2	P33328	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MED6	P38782	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YGL034C	P53186	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	AIM36	Q03798	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	SPO13	P23624	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	GPX1	P36014	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MBA1	P38300	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MTC6	P38849	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YPL073C	P40323	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	MIC19	P43594	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YJL043W	P47053	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	AVT1	P47082	602 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	XPT1	P47165	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YGR018C	P53211	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	TIM13	P53299	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	YGR219W	P53307	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	NRM1	P53718	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DDC1	YPL194W	RNH201	P53942	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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