RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A KAP114P53067 1004 aa0.08□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YNL046WP53956 172 aa0.08□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YPR098CQ06089 161 aa0.08□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A MSH5Q12175 901 aa0.08□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A SGE1P33335 543 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YBR063CP38083 404 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A PRS2P38620 318 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A EDC3P39998 551 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YFL065CP43539 102 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A DOC1P53068 250 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YNR077CP53758 84 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A POP3P53833 195 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data0.07□□□□□ -2.4not detected
YMR001C-AYMR001C-A YLR413WQ06689 675 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A LCL2Q08045 131 aa0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A RPS5P26783 225 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A HOM6P31116 359 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YET1P35723 206 aa0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YAE1P47118 141 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A ALG11P53954 548 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A TRM12Q04235 462 aa0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A PSF1Q12488 208 aa0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A PDR18P53756 1333 aa0.06□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A MRPL40P36534 297 aa0.05□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A SIP3P38717 1229 aa0.05□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A FLX1P40464 311 aa0.05□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A RCE1Q03530 315 aa0.05□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YHR139C-AO13536 103 aa0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A ERD2P18414 219 aa0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A CAT5P41735 233 aa0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A ILM1P47155 203 aa0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A ARO8P53090 500 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YPL229WQ99395 206 aa0.04□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A MRPS28P21771 286 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YBR209WP38311 105 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YHL042WP38729 150 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A KNH1P50112 268 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A ABF2Q02486 183 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A GAS3Q03655 524 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa0.03□□□□□ -2.4
YMR001C-AYMR001C-A MRP1P10662 321 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A UMP1P38293 148 aa0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A GLG2P47011 380 aa0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A CWC27Q02770 301 aa0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YML096WQ04489 525 aa0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YOL160WQ08321 113 aa0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A COX2P00410 251 aa0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A REP2P03872 296 aa0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A DBP3P20447 523 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A USE1P53146 245 aa0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YNL010WP53981 241 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A RHO3Q00245 231 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YDR209CQ03480 137 aa0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A SEI1Q06058 285 aa0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YOR029WQ12243 111 aa0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A OPY1P38271 328 aa0□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YHR127WP38833 243 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A PEX17P40155 199 aa0□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A ADH6Q04894 360 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A DAL82P21705 255 aa-0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A OPI1P21957 404 aa-0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A SNC2P33328 115 aa-0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A EGD1Q02642 157 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A FSF1Q12029 327 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A TUS1Q06412 1307 aa-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YPR170W-BP0C5R9 85 aa-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A KRR1P25586 316 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A STP22P25604 385 aa-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A UGX2P32772 223 aa-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.02□□□□□ -2.41not detected
YMR001C-AYMR001C-A YNL247WP53852 767 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A COX20Q04935 205 aa-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YHR007C-AQ07074 71 aa-0.02□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A RIB1P38066 345 aa-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YEA4P40004 342 aa-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YMR144WP40214 342 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YAR1P46683 200 aa-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A DID2P69771 204 aa-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A YDR248CQ03786 193 aa-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A ATG40Q99325 256 aa-0.03□□□□□ -2.41
YMR001C-AYMR001C-A RPL24AP04449 155 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YKL075CP36083 450 aa-0.04□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A IRC22P40006 225 aa-0.04□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SNZ1Q03148 297 aa-0.04□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YMD8Q03697 442 aa-0.04□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A CSM4Q08955 156 aa-0.04□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A FAS1P07149 2051 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YLR236CA0A023PZG4 107 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SIR2P06700 562 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SEC11P15367 167 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.05□□□□□ -2.42not detected
YMR001C-AYMR001C-A MRPL17P36528 281 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A URA8P38627 578 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SWP1Q02795 286 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YML108WQ03759 105 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A GPM2Q12008 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A POL30P15873 258 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
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