RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SDT1	P53078	280 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	RSM27	P53305	110 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	DID2	P69771	204 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	ABF2	Q02486	183 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YOL024W	Q08172	172 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SEC22	P22214	214 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	TRX3	P25372	127 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	MGT1	P26188	188 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	TCA17	P32613	152 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YEL045C	P32616	141 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SFC1	P33303	322 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	SEO1	P39709	593 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YMD8	Q03697	442 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.65	□□□□□ -1.82
RPS0B	YLR048W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	ACP1	P32463	125 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YKR041W	P36134	250 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	DOG2	P38773	246 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	DOG1	P38774	246 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	BDH1	P39714	382 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	PEX12	Q04370	399 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	PAN1	P32521	1480 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	MEI4	P29467	408 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RNP1	P32385	249 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	PTM1	P32857	523 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YOX1	P34161	385 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	CLG1	P35190	452 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	MSA2	P36157	363 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RMD6	P39975	231 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YER076C	P40049	302 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	MEP2	P41948	499 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	COQ5	P49017	307 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	MDM34	P53083	459 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YNL184C	P53876	108 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	GGA1	Q06336	557 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	PRR2	Q12310	699 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.64	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.63	□□□□□ -1.83	not detected
RPS0B	YLR048W	DER1	P38307	211 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YGL235W	P53071	178 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YGR050C	P53231	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	CDC7	P06243	507 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	SIR2	P06700	562 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	FCY2	P17064	533 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	PCL1	P24867	279 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RPA43	P46669	326 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	UBC12	P52491	188 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	COG5	P53951	403 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	HAL1	Q01766	294 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	NUP49	Q02199	472 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	MRX8	Q05473	314 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	IES3	Q12345	250 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	DSF1	P0CX08	502 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	TRR2	P38816	342 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	IRC22	P40006	225 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	FLC3	P53121	802 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	LPP1	Q04396	274 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YLR053C	Q12026	108 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	NSL1	Q12143	216 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	SNF4	P12904	322 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	CUP2	P15315	225 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	ARO7	P32178	256 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	RCN1	P36054	211 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RPS0B	YLR048W	YBR063C	P38083	404 aa		3.6	□□□□□ -1.83

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