RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C CAM1P29547 415 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C VMA6P32366 345 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ASF2P32448 525 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CLB6P32943 380 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RCN1P36054 211 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MRX3P38172 270 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data1.69□□□□□ -2.14not detected
CSE4YKL049C YHI9P38765 294 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data1.69□□□□□ -2.14not detected
CSE4YKL049C RCY1P39531 840 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YER137CP40083 148 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PEP8P40335 379 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C HPM1P40481 377 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YRB2P40517 327 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SNX4P47057 423 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CWC23P52868 283 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PNC1P53184 216 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NOP19P53317 196 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RCF2P53721 224 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CUS2P53830 285 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YNL260CP53846 198 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FMP41P53889 259 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C HPT1Q04178 221 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NEJ1Q06148 342 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YLR031WQ07978 186 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YOL019WQ08157 551 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NSL1Q12143 216 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RTR2Q12378 196 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MED11Q99278 115 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MYO1P08964 1928 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YGL041W-AP0C5N3 154 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GRX2P17695 143 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CCA1P21269 546 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ACP1P32463 125 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C UTP30P36144 274 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GOS1P38736 223 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CYC2P38909 366 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C AVT2P39981 480 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YER034WP40022 185 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YFH7P43591 353 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PEX31P53203 462 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YNL010WP53981 241 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PEX12Q04370 399 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ECM18Q04623 453 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YDR278CQ05612 105 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CTS2Q06350 511 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C LOA1Q06508 300 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MDM32Q12171 622 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YOR342CQ12182 319 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YBL112CQ3E7Y4 105 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MHF1Q3E835 90 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FKS1P38631 1876 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RIF1P29539 1916 aa1.68□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YAL064W-BO13512 126 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TDH1P00360 332 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C IPP1P00817 287 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RPS3P05750 240 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RHO1P06780 209 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C COS2P0CX12 379 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C COS3P0CX13 379 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TOM40P23644 387 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ATG22P25568 528 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RNP1P32385 249 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C HYM1P32464 399 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ARC19P33204 171 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GDH2P33327 1092 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PTC1P35182 281 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TAF14P35189 244 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CSG2P35206 410 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YBR285WP38354 144 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ARN2P38724 620 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C EGD2P38879 174 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MTW1P39731 289 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DDI1P40087 428 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TIR3P40552 269 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SER2P42941 309 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C LSM1P47017 172 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C APS3P47064 194 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C JAC1P53193 184 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CPD1P53314 239 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YNL033WP53964 284 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YNL019CP53975 284 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SDC1Q03323 175 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TRM12Q04235 462 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C COX20Q04935 205 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SPO77Q06134 477 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SUE1Q06524 206 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ZEO1Q08245 113 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YNG1Q08465 219 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C VPS68Q12016 184 aa1.67□□□□□ -2.14
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