RNA–Protein interactions for RNA: YJL025W

RRN7, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN7, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN7	YJL025W	NBP35	P52920	328 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YGL235W	P53071	178 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PDR17	P53844	350 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GMC1	Q04399	608 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	COQ10	Q08058	207 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MCT1	Q12283	360 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ERV2	Q12284	196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PEX34	P25584	144 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MRPL28	P36527	147 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MIX23	P38162	196 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ECM13	P38195	257 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GOS1	P38736	223 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MTC6	P38849	526 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MDM31	P38880	579 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PAN6	P40459	309 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	IKS1	P47042	667 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MOG1	P47123	218 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	COG7	P53195	279 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	COS6	P53344	381 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SUR7	P54003	302 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RIF2	Q06208	395 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	LDB18	Q07887	179 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	HMS1	Q12398	434 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MET2	P08465	486 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	CPT1	P17898	393 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PHO80	P20052	293 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	FUN26	P31381	517 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MED8	P38304	223 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SER33	P40510	469 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MOB2	P43563	287 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YGL204C	P53089	101 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SPC24	Q04477	213 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GRX8	Q05926	109 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	FAR10	Q06001	478 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SEI1	Q06058	285 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR177W	Q06251	628 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	FCY22	Q12119	530 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MRX4	Q12467	430 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AGC1	Q12482	902 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ATR1	P13090	542 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YCR099C	P25657	155 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SPS18	P32572	300 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PTM1	P32857	523 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	CIN5	P40917	295 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AZF1	P41696	914 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	LCB3	P47013	409 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AIF1	P52923	378 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TVP15	Q03860	143 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SPG4	Q04438	115 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GAS2	Q06135	555 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PEX11	Q12462	236 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	GCN3	P14741	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	YCR022C	P25620	114 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	PTC1	P35182	281 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	MRPL39	P36533	70 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	YBR137W	P38276	179 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	RCK1	P38622	512 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	MED6	P38782	295 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	YND1	P40009	630 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	EMC4	P53073	190 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	YNR066C	P53752	436 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	SCS7	Q03529	384 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	TDA1	Q03533	586 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	LIP2	Q06005	328 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	DXO1	Q06349	442 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RRN7	YJL025W	YLR046C	Q12253	270 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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