RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FZD8Q9H461 694 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 REC8O95072 547 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 NR5A1Q13285 461 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FAM187BQ17R55 369 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 LONP2Q86WA8 852 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 IRF7Q92985 503 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ASB16Q96NS5 453 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 USP20Q9Y2K6 914 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.58□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ARNTLO00327 626 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 WNT7AO00755 349 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 N4BP3O15049 544 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CDKL5O76039 1030 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 MICAL2O94851 1124 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 EDN1P05305 212 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PTPN2P17706 415 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 XBP1P17861 261 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PTGDRQ13258 359 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ACAP1Q15027 740 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CALCRLQ16602 461 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 VITQ6UXI7 678 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 BSNDQ8WZ55 320 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TNFRSF25Q93038 417 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.58□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CTDNEP1O95476 244 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PSMC3P17980 439 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 GDI1P31150 447 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CCR2P41597 374 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 WDR44Q5JSH3 913 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 AKAP13Q12802 2813 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 NCANO14594 1321 aa14.57□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 WDR27A2RRH5 827 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 I3L4J1 428 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 B3GAT3O94766 335 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PRKCBP05771 671 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ZNF806P0C7X5 589 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CCNE1P24864 410 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 HOXA6P31267 233 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 HOXC13P31276 330 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 KRT2P35908 639 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TXKP42681 527 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CLCNKBP51801 687 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CORO1BQ9BR76 489 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 CCDC113Q9H0I3 377 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 GDAQ9Y2T3 454 aa14.56□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 NEMFO60524 1076 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 MOSPD3O75425 235 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 ABLIM3O94929 683 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 KCNK5O95279 499 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 C1QTNF9P0C862 333 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 LIG1P18858 919 aa14.55□□□□□ -0.08
CTIF-211ENST00000592658 BRCC3P46736 316 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms