RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 OTOP2Q7RTS6 562 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 HELQQ8TDG4 1101 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PI4K2AQ9BTU6 479 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 DPP3Q9NY33 737 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SIX4Q9UIU6 781 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 OFD1O75665 1012 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 POMCP01189 267 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ITGB3P05106 788 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PFKMP08237 780 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 KRT19P08727 400 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PIK3CAP42336 1068 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 EPHB4P54760 987 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 LRMPQ12912 555 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.835e-7■■□□□ 14.5
EFTUD2-223ENST00000592576 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NOL4O94818 638 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 THP07101 528 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CXorf38Q8TB03 319 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SIX2Q9NPC8 291 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 UPP2O95045 317 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GYPCP04921 128 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 MYL6P60660 151 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TRPC3Q13507 836 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF365Q70YC5 407 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 BEST2Q8NFU1 509 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NEK11Q8NG66 645 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GATMP50440 423 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NAB2Q15742 525 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SPOPLQ6IQ16 392 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GJB7Q6PEY0 223 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.833e-7■□□□□ 11
EFTUD2-223ENST00000592576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PPEF2O14830 753 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 INPPL1O15357 1258 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CLSTN1O94985 981 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 UCHL3P15374 230 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 DEFB103AP81534 67 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ABI1Q8IZP0 508 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GANQ9H2C0 597 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CASP14P31944 242 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 RRAGAQ7L523 313 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 TATDN2Q93075 761 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NUP58Q9BVL2 599 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NLRC4Q9NPP4 1024 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 EFCAB14O75071 495 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 BAIAP3O94812 1187 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 FGBP02675 491 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 CYP3A5P20815 502 aa9.86□□□□□ -0.83
EFTUD2-223ENST00000592576 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms