RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577667.1

PPP4R1-205, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 1, human

TSL 4

Gene PPP4R1, Length 560 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R1-205	ENST00000577667	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667		A0A1B0GTW7	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	TEX33	O43247	280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CLSTN1	O94985	981 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC6A2	P23975	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC6A9	P48067	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MTNR1B	P49286	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SCAP	Q12770	1279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SEPT2	Q15019	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GPR32	O75388	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FGFR4	P22455	802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FDXR	P22570	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GCSH	P23434	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PCSK1	P29120	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CXCR5	P32302	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ERVK-21	P61565	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CXADR	P78310	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	HSD11B2	P80365	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MPP3	Q13368	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MYOC	Q99972	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRSS23	O95084	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ESRRB	O95718	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PLA2G5	P39877	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRR16	Q569H4	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667		Q96MF0	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MAST3	O60307	1309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667		K7ESF4	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GPANK1	O95872	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	AMY1A	P04745	511 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ALAS1	P13196	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	AGXT	P21549	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MPL	P40238	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	MTM1	Q13496	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PPP4R1-205	ENST00000577667	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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