RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567114.5

RPUSD1-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-208	ENST00000567114	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	NOL4	O94818	638 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	CLSTN1	O94985	981 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	ITGB3	P05106	788 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	BEST2	Q8NFU1	509 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	DPF3	Q92784	378 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	TPM1	P09493	284 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	CASP14	P31944	242 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	TRIM14	Q14142	442 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	SIX2	Q9NPC8	291 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	MIOS	Q9NXC5	875 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.59	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	OFD1	O75665	1012 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	TH	P07101	528 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	PFKM	P08237	780 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	FGFR1	P11362	822 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	SYN1	P17600	705 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	SCNN1G	P51170	649 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	WDR44	Q5JSH3	913 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	SIX4	Q9UIU6	781 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		27.58	■■■□□ 2.01
RPUSD1-208	ENST00000567114	UCHL3	P15374	230 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	MYL6	P60660	151 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	FIGN	Q5HY92	759 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GJB7	Q6PEY0	223 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	IL23A	Q9NPF7	189 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	TTC3	P53804	2025 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	POMC	P01189	267 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	IQCD	Q96DY2	449 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GAN	Q9H2C0	597 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	FPGS	Q05932	587 aa		27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CXorf38	Q8TB03	319 aa		27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	NT5C1B	Q96P26	610 aa		27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CEP72	Q9P209	647 aa		27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	RBP5	P82980	135 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	RRAGA	Q7L523	313 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	TATDN2	Q93075	761 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114		A0A1W2PQJ5	194 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CYP3A5	P20815	502 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ABI1	Q8IZP0	508 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		27.54	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	UPP2	O95045	317 aa		27.54	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	GSDMD	P57764	484 aa		27.54	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		27.54	■■■□□ 2
RPUSD1-208	ENST00000567114	IQCE	Q6IPM2	695 aa		27.54	■■■□□ 2

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