RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 MYH11P35749 1972 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 SYN3O14994 580 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 GFRA3O60609 400 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 NCKAP1LP55160 1127 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 MCL1Q07820 350 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 PARM1Q6UWI2 310 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ITFG1Q8TB96 612 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 POLIQ9UNA4 740 aa21.92■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ROR1Q01973 937 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 SEZ6Q53EL9 994 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 LRRC15Q8TF66 581 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 CA14Q9ULX7 337 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.91■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 CLDN3O15551 220 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 SUSD3Q96L08 255 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 ODF2LQ9ULJ1 636 aa21.9■■□□□ 1.1
MFGE8-208ENST00000558773 WDR27A2RRH5 827 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 H0YCG3 227 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 H7C4K7 107 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ATF2P15336 505 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 UBA7P41226 1012 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 GPC5P78333 572 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ZBTB6Q15916 424 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 MTSS1LQ765P7 747 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.89■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 DMDP11532 3685 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 TTC26A0AVF1 554 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 STK25O00506 426 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CLTAP09496 248 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 SCP2P22307 547 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF131P52739 623 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 BRAPQ7Z569 592 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CALML4Q96GE6 196 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 REEP2Q9BRK0 252 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.88■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CFAP54Q96N23 3096 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 BMP15O95972 392 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 PIGRP01833 764 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CXCL8P10145 99 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 LRPAP1P30533 357 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 STARD6P59095 220 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 GRIN1Q05586 938 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ANGPT1Q15389 498 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 TPGS2Q68CL5 300 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 POTEHQ6S545 545 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 GPBP1Q86WP2 473 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 DDX12PQ92771 950 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.87■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 FAM189A1O60320 539 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 SEC24AO95486 1093 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ADRB2P07550 413 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 RHOP08100 348 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 PTPN2P17706 415 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 ELF1P32519 619 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CUL4AQ13619 759 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 APPL2Q8NEU8 664 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 TBX20Q9UMR3 447 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 PRR23AA6NEV1 266 aa21.85■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 M0QZQ0 153 aa21.85■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 LRG1P02750 347 aa21.85■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 CYP3A5P20815 502 aa21.85■■□□□ 1.09
MFGE8-208ENST00000558773 MCM4P33991 863 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms