RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 IQUBQ8NA54 791 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 VWA8A3KMH1 1905 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PLXNA3P51805 1871 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RFPL2O75678 378 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CASP1P29466 404 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ACOT2P49753 483 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CES5AQ6NT32 575 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RNF135Q8IUD6 432 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 KIF12Q96FN5 646 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 KYAT1Q16773 422 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ADALQ6DHV7 355 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 GPR149Q86SP6 731 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ACCSQ96QU6 501 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 MTHFRP42898 656 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CREMQ03060 361 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 JADE1Q6IE81 842 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 MTRRQ9UBK8 725 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-222ENST00000550996 PPEF2O14830 753 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 PAPLNO95428 1278 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 C1RP00736 705 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 NFICP08651 508 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 LRPAP1P30533 357 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 HOXD13P35453 343 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 ASIC1P78348 528 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 FAM212AQ96EL1 285 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SPATA32Q96LK8 384 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 DCXO43602 365 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 TRAPPC3O43617 180 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 CYP3A5P20815 502 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 WNT7BP56706 349 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 KRT85P78386 507 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 EHHADHQ08426 723 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 ALCAMQ13740 583 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SUSD3Q96L08 255 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 PFKFB1P16118 471 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 CMA1P23946 247 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 OR1D2P34982 312 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 AMPD3Q01432 767 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 CUL4BQ13620 913 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 RAB33AQ14088 237 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 BECN1Q14457 450 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SPATA1Q5VX52 437 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 PDXDC1Q6P996 788 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SAAL1Q96ER3 474 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 HPSEQ9Y251 543 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 A0A1B0GVL5 298 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 SYN3O14994 580 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 TBC1D4O60343 1298 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 AFMP43652 599 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CS-222ENST00000550996 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms