RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 UQCRHP07919 91 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PTPN21Q16825 1174 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GBF1Q92538 1859 aa8.2□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DCXO43602 365 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ARL2P36404 184 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RCAN1P53805 252 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TNK2Q07912 1038 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ADAM15Q13444 863 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DSC3Q14574 896 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DDR2Q16832 855 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FAM26DQ5JW98 314 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DCLK2Q8N568 766 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MARCH5Q9NX47 278 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GLUD2P49448 558 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CDH8P55286 799 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZP2Q05996 745 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PTPN14Q15678 1187 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.2□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 STK36Q9NRP7 1315 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GUA9 196 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 INPPL1O15357 1258 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 CUL4BQ13620 913 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 JADE1Q6IE81 842 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PARM1Q6UWI2 310 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 RFC5P40937 340 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CYP4F8P98187 520 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 SPATA32Q96LK8 384 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 TTPALQ9BTX7 342 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 KCNK12Q9HB15 430 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 PANK4Q9NVE7 773 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 ITGB3P05106 788 aa8.18□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZNF410Q86VK4 478 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 HACE1Q8IYU2 909 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MYADMQ96S97 322 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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