RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMX3Q96JJ7 454 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 NUB1Q9Y5A7 615 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SYN3O14994 580 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TOM1L1O75674 476 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SMTNP53814 917 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A3P55017 1021 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ARPP19P56211 112 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ING5Q8WYH8 240 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 KXD1Q9BQD3 176 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 FOXQ1Q9C009 403 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 WDR27A2RRH5 827 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 H3BQV1 296 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 PRRG1O14668 218 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D4O60343 1298 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ABLIM3O94929 683 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 LRG1P02750 347 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G4BP0C869 781 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 GJB2P29033 226 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ELF1P32519 619 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 STARD6P59095 220 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 NOTCH4Q99466 2003 aa18.49■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 H7C4K7 107 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 RHOP08100 348 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 PTPN2P17706 415 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ZPBP2Q6X784 338 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SHDQ96IW2 340 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 KCND2Q9NZV8 630 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.48■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CLDN3O15551 220 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 LRRN2O75325 713 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ATF2P15336 505 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MCM4P33991 863 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SPAG1Q07617 926 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MCL1Q07820 350 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SLC44A4Q53GD3 710 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ARSHQ5FYA8 562 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 POTEHQ6S545 545 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TCEAL8Q8IYN2 117 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TMEM130Q8N3G9 435 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 PJA1Q8NG27 643 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SUSD3Q96L08 255 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 HAPLN2Q9GZV7 340 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.47■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CITO14578 2027 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SEC24AO95486 1093 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CXCL8P10145 99 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 GLULP15104 373 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CEBPBP17676 345 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ZNF280DQ6N043 979 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ADSSL1Q8N142 457 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 DDX12PQ92771 950 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 BICD1Q96G01 975 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 CORO1BQ9BR76 489 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 GDE1Q9NZC3 331 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 COL4A3Q01955 1670 aa18.46■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 KANSL1LA0AUZ9 987 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 CLTAP09496 248 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 NCKAP1LP55160 1127 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 PFKPQ01813 784 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 PRKCQQ04759 706 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 TPGS2Q68CL5 300 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 APPL2Q8NEU8 664 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 REEP2Q9BRK0 252 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.45■□□□□ 0.54
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa18.45■□□□□ 0.54
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