RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 SENP1Q9P0U3 644 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 KLRC4O43908 158 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CST8O60676 142 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZBTB7AO95365 584 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PRKCBP05771 671 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PDGFRAP16234 1089 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 STX1BP61266 288 aa8.51□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.51□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 KDSRQ06136 332 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SLC12A1Q13621 1099 aa8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.5□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 EXT2Q93063 718 aa8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.5□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 A8MXQ7 604 aa8.49□□□□□ -1.05
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NEK1-208ENST00000512193 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 BCL9O00512 1426 aa8.49□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.49□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CYP11B1P15538 503 aa8.49□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 AP1B1Q10567 949 aa8.49□□□□□ -1.05
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