RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 SHBGP04278 402 aa13.74□□□□□ -0.21
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PRAME-213ENST00000492657 CUL2Q13617 745 aa13.72□□□□□ -0.21
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PRAME-213ENST00000492657 EPN3Q9H201 632 aa13.72□□□□□ -0.21
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PRAME-213ENST00000492657 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 PCYOX1Q9UHG3 505 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.215e-24■□□□□ 10.9
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PRAME-213ENST00000492657 MDH1P40925 334 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 TMEM63BQ5T3F8 832 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.72□□□□□ -0.21
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PRAME-213ENST00000492657 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 SMIM23A6NLE4 172 aa13.71□□□□□ -0.21
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PRAME-213ENST00000492657 HSPA6P17066 643 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 NSFP46459 744 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 IFFO1Q0D2I5 559 aa13.71□□□□□ -0.21
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PRAME-213ENST00000492657 EMC10Q5UCC4 262 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 LRRC71Q8N4P6 559 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 OTUD5Q96G74 571 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 FAM118BQ9BPY3 351 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 HEMGNQ9BXL5 484 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 ELP3Q9H9T3 547 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-213ENST00000492657 RASAL2Q9UJF2 1139 aa13.71□□□□□ -0.21
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