RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TCEAL1Q15170 157 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 MTFR1Q15390 333 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 FAM187BQ17R55 369 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 EPC2Q52LR7 807 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 GPR142Q7Z601 462 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CAGE1Q8TC20 777 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF333Q96JL9 665 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PBKQ96KB5 322 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 WDR24Q96S15 920 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TINF2Q9BSI4 451 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TCHPQ9BT92 498 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 MIS12Q9H081 205 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 EFCC1Q9HA90 598 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 RAB20Q9NX57 234 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 NAGPAQ9UK23 515 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 GABRQQ9UN88 632 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PTPRFP10586 1907 aa6.85□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 LAMA3Q16787 3333 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC151A5D8V7 595 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TLR2O60603 784 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PHACTR2O75167 634 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TADA3O75528 432 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CLSTN1O94985 981 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TNNI1P19237 187 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 GLRA2P23416 452 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 AXLP30530 894 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 KLK7P49862 253 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CPT1AP50416 773 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 FAM193AP78312 1265 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 MCL1Q07820 350 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PLCB4Q15147 1175 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PTPN21Q16825 1174 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 LY6KQ17RY6 165 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ZACNQ401N2 412 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 WDR49Q8IV35 697 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 RFFLQ8WZ73 363 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ITPKCQ96DU7 683 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CGRRF1Q99675 332 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CARD6Q9BX69 1037 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ASB7Q9H672 318 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 SPC25Q9HBM1 224 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 SIX2Q9NPC8 291 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 SNX12Q9UMY4 172 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.84□□□□□ -1.31
SF3A3-208ENST00000489537 NRCAMQ92823 1304 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 A0A087X0T9 212 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 H3BM21 787 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 H3BRB1 525 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC188H7C350 402 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 EPHB6O15197 1021 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 RTN2O75298 545 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 TNNC2P02585 160 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 LGALS2P05162 132 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 PRKCBP05771 671 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 PGK2P07205 417 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 FAM228BP0C875 321 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 MCF2P10911 925 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 BMP2P12643 396 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 ADSSP30520 456 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 GCLMP48507 274 aa6.83□□□□□ -1.32
SF3A3-208ENST00000489537 SNX16P57768 344 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms