RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 MTMR12Q9C0I1 747 aa27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 CXCL16Q9H2A7 254 aa27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 CNTN3Q9P232 1028 aa27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 C2CD2Q9Y426 696 aa27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.95■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 SKIP12755 728 aa27.95■■■□□ 2.06
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SOBP-202ENST00000477448 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
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SOBP-202ENST00000477448 NEK11Q8NG66 645 aa27.95■■■□□ 2.06
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SOBP-202ENST00000477448 PTPRSQ13332 1948 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 ENPP3O14638 875 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 MFAP3LO75121 409 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 UCHL3P15374 230 aa27.89■■■□□ 2.06
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