RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-206ENST00000446904 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-206ENST00000446904 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP4-206ENST00000446904 VWA8A3KMH1 1905 aa11.27□□□□□ -0.6
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF292O60281 2723 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 POU2F2P09086 479 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G4BP0C869 781 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 GJB2P29033 226 aa11.27□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 SMTNP53814 917 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ARPP19P56211 112 aa11.27□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KXD1Q9BQD3 176 aa11.27□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 FOXQ1Q9C009 403 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CNTN3Q9P232 1028 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.27□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 24.9
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SH3BP4-206ENST00000446904 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIP11Q15643 1979 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 F5P12259 2224 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 H7C4K7 107 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 CLDN3O15551 220 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 SEC24AO95486 1093 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 ARSHQ5FYA8 562 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZPBP2Q6X784 338 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 RTL10Q7L3V2 364 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF461Q8TAF7 563 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 SHDQ96IW2 340 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.25□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN2P17706 415 aa11.24□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 STARD6P59095 220 aa11.24□□□□□ -0.61
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SH3BP4-206ENST00000446904 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF280DQ6N043 979 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 POTEHQ6S545 545 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 GPBP1Q86WP2 473 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 APPL2Q8NEU8 664 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 PJA1Q8NG27 643 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC15Q8TF66 581 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP4-206ENST00000446904 TCEAL4Q96EI5 215 aa11.24□□□□□ -0.61
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