RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.43■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RGS20O76081 388 aa25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RARGP13631 454 aa25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RPL21P46778 160 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0754O94854 1291 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ACTR2P61160 394 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ADCY2Q08462 1091 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ZACNQ401N2 412 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TREML2Q5T2D2 321 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TATDN2Q93075 761 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 VCPIP1Q96JH7 1222 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ZIC5Q96T25 663 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.41■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 C5orf60A6NFR6 353 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 RARAP10276 462 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ICAM3P32942 547 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 COPB2P35606 906 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 PRKCEQ02156 737 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 DRP2Q13474 957 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 WDR44Q5JSH3 913 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 AADACL2Q6P093 401 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 MCOLN2Q8IZK6 566 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ACAD9Q9H845 621 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 WHRNQ9P202 907 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 E7EVH7 732 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CXCL11O14625 94 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ATG7O95352 703 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CREBZFQ9NS37 354 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ECEL1O95672 775 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 MAPK4P31152 587 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 CENPCQ03188 943 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 BICD1Q96G01 975 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PMS1-205ENST00000409985 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 AGTP01019 485 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SLC10A3P09131 477 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 LIG4P49917 911 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 STRN3Q13033 797 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 C6orf89Q6UWU4 347 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ACP6Q9NPH0 428 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SIP14410 1827 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 KRT5P13647 590 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 NAMPTP43490 491 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 DNERQ8NFT8 737 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 GRK7Q8WTQ7 553 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ZNF516Q92618 1163 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 FNBP1Q96RU3 617 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 TMEM51Q9NW97 253 aa25.38■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ITIH2P19823 946 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 SEC24CP53992 1094 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CAV1Q03135 178 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 PTPN18Q99952 460 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.37■■□□□ 1.65
PMS1-205ENST00000409985 FSBPO95073 299 aa25.36■■□□□ 1.65
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