RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 CYLDQ9NQC7 956 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA6Q9UN73 950 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HPSEQ9Y251 543 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 A0A0U1RQJ8 604 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MYMKA6NI61 221 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L5A8MUK1 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L15C9J2P7 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L11C9JVI0 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L18D6R9N7 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L22D6RA61 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L19D6RCP7 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L20D6RJB6 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 OATP04181 439 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SPDYE6P0CI01 402 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PMLP29590 882 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SLC1A1P43005 524 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NUP107P57740 925 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MECOMQ03112 1051 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 DDR1Q08345 913 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L24Q0WX57 530 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 RASA2Q15283 850 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ACCSLQ4AC99 568 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 USP17L6PQ6QN14 398 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MICU2Q8IYU8 434 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MKNK1Q9BUB5 465 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MSTO1Q9BUK6 570 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MYLK2Q9H1R3 596 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SENP2Q9HC62 589 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PICK1Q9NRD5 415 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 BARHL2Q9NY43 387 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CEP170Q5SW79 1584 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.3□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 OCM2P0CE71 109 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ERVK-9P63128 1117 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 LRRC6Q86X45 466 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CNDP1Q96KN2 507 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 COG4Q9H9E3 785 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 GSG1L2A8MUP6 293 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SNAP23O00161 211 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D4O60343 1298 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TBCCQ15814 346 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 WLSQ5T9L3 541 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NDUFAF2Q8N183 169 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TATDN2Q93075 761 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SPATA17Q96L03 361 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 APEX2Q9UBZ4 518 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 DAPK2Q9UIK4 370 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB39O15060 712 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 FKBP6O75344 327 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SCARF1Q14162 830 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ALX1Q15699 326 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 EFHC1Q5JVL4 640 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CHD1O14646 1710 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MYO3BQ8WXR4 1341 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 PDXKO00764 312 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SLC16A4O15374 487 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ABL1P00519 1130 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 APRTP07741 180 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CDK8P49336 464 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 MTERF2Q49AM1 385 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CDKAL1Q5VV42 579 aa10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 ACTRT1Q8TDG2 376 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 179.1 ms