RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 C2CD2Q9Y426 696 aa22.07■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 SQORQ9Y6N5 450 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 CD4P01730 458 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ITGB3P05106 788 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 SELPP16109 830 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 GPR88Q9GZN0 384 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 RNF39Q9H2S5 420 aa22.06■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 FAM81BQ96LP2 452 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.05■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 CCP110O43303 1012 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 AKR1B10O60218 316 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 EVI5O60447 810 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 OFD1O75665 1012 aa22.04■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 CCDC172P0C7W6 258 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ITGA4P13612 1032 aa22.04■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 ZNF699Q32M78 642 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.04■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 DPP3Q9NY33 737 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 CNTN3Q9P232 1028 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 DERAQ9Y315 318 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.04■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.03■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 KIF11P52732 1056 aa22.03■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 CUL2Q13617 745 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM60Q495X7 471 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 RNF169Q8NCN4 708 aa22.03■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 SHC3Q92529 594 aa22.03■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.03■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 PRKCIP41743 596 aa22.02■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.02■■□□□ 1.12
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ATG4B-204ENST00000402096 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 PTK2Q05397 1052 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 SPA17Q15506 151 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 LPPQ93052 612 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-204ENST00000402096 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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