RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.64■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 OATP04181 439 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 MON1BQ7L1V2 547 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DEPTORQ8TB45 409 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 AZI2Q9H6S1 392 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TLDC2A0PJX2 215 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 NFKBIEO00221 500 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 PROSCO94903 275 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ACO1P21399 889 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CAV1Q03135 178 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT17Q04695 432 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 PTK6Q13882 451 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CUL2Q13617 745 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 STXBP2Q15833 593 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 K7ERI5 159 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 PSTPIP1O43586 416 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ARL2P36404 184 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DNERQ8NFT8 737 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SNF8Q96H20 258 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CGRRF1Q99675 332 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 RASGRF2O14827 1237 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 VNN1O95497 513 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 GAS8O95995 478 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CALCAP01258 141 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 FGFR4P22455 802 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 GLRA2P23416 452 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 IFT88Q13099 833 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 MFSD5Q6N075 450 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ASAP3Q8TDY4 903 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM143Q96AN5 459 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DCLK3Q9C098 648 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 EFCC1Q9HA90 598 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 RFC5P40937 340 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ACOT2P49753 483 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SEC16BQ96JE7 1060 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SCINQ9Y6U3 715 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SIP14410 1827 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP4AP20648 1035 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 DRD4P21917 467 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CHST13Q8NET6 341 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CHN1P15882 459 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 PLCB4Q15147 1175 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ATL2Q8NHH9 583 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 MDM1Q8TC05 714 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 A0A0B4J269 797 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CLTAP09496 248 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 BAG6P46379 1132 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 WNT7BP56706 349 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 NOMO3P69849 1222 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SP2Q02086 613 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 QPCTQ16769 361 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CABS1Q96KC9 395 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM84AQ96KN4 292 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM7Q9C029 511 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 CHST7Q9NS84 486 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SORBS3O60504 671 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 GNA15P30679 374 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 SNX1Q13596 522 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-202ENST00000399409 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms