RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 CLCNKBP51801 687 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB33AQ14088 237 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB6Q15916 424 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LILRA6Q6PI73 481 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR149Q86SP6 731 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CEP57Q86XR8 500 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 BEST2Q8NFU1 509 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 DHX58Q96C10 678 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM9Q9C026 710 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 USTQ9Y2C2 406 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 C2CD2Q9Y426 696 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MYO10Q9HD67 2058 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LACTBL1A8MY62 500 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 F8W810 466 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 DCXO43602 365 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM189A1O60320 539 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CXCL8P10145 99 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ASIC1P78348 528 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PKP1Q13835 747 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RTP2Q5QGT7 225 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LIN9Q5TKA1 542 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 UNC13DQ70J99 1090 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 STAMQ92783 540 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF12Q96FN5 646 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SUSD3Q96L08 255 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CD320Q9NPF0 282 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.24□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 UBE4BO95155 1302 aa9.24□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.23□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PQ64 194 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PQD8 194 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TGM5O43548 720 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR37L1O60883 481 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 XYLBO75191 536 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMYND10O75800 440 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 POU2F2P09086 479 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 HOXA9P31269 272 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MCM4P33991 863 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMD2Q13200 908 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SURF1Q15526 300 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA1Q5VX52 437 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TPGS2Q68CL5 300 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PALB2Q86YC2 1186 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF135Q8IUD6 432 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 HASPINQ8TF76 798 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RABGGTAQ92696 567 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 M0QZQ0 153 aa9.22□□□□□ -0.93
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