RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383331.4

HCG27-201, Transcript of HLA complex group 27, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HCG27, Length 1,720 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG27-201ENST00000383331 SETD4Q9NVD3 440 aa16.03■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.03■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.03■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 ANKRD62A6NC57 917 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 FTCDO95954 541 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 HMGCRP04035 888 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 USP8P40818 1118 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 AP3M2P53677 418 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 RFFLQ8WZ73 363 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 RAB21Q9UL25 225 aa16.02■□□□□ 0.16
HCG27-201ENST00000383331 INHAP05111 366 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GZMAP12544 262 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 HOXC8P31273 242 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TNFSF9P41273 254 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PIK3CAP42336 1068 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GJA8P48165 433 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 BEX3Q00994 111 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TCEAL1Q15170 157 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SEZ6Q53EL9 994 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 WDR44Q5JSH3 913 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ZBTB33Q86T24 672 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CAGE1Q8TC20 777 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TCHPQ9BT92 498 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RNF14Q9UBS8 474 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TNFSF13BQ9Y275 285 aa16.02■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 A0A087WZ62 844 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CYP11B1P15538 503 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 FMO1Q01740 532 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 BIRC3Q13489 604 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 GNASQ5JWF2 1037 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 WDR49Q8IV35 697 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ANK1P16157 1881 aa16.01■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CES2O00748 559 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 B4GALT5O43286 388 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 RTN2O75298 545 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 FTLP02792 175 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 VTNP04004 478 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 IQCF3P0C7M6 154 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CXCR5P32302 372 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CDR2Q01850 454 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 BRD3Q15059 726 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SURF1Q15526 300 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 NLRP7Q8WX94 980 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 THAP2Q9H0W7 228 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ACP6Q9NPH0 428 aa16■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CCDC151A5D8V7 595 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ADAMTS4O75173 837 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TUBBP07437 444 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 CYP2C9P11712 490 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PDE6CP51160 858 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 AMHR2Q16671 573 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 KYAT1Q16773 422 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 NME8Q8N427 588 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 C7orf31Q8N865 590 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ARHGEF26Q96DR7 871 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PNKPQ96T60 521 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 PSMB7Q99436 277 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 ABCB6Q9NP58 842 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
HCG27-201ENST00000383331 KIF4AO95239 1232 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms