RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEA4P43358 317 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 VAMP7P51809 220 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 OCRLQ01968 901 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TPH2Q8IWU9 490 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NEU2Q9Y3R4 380 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NFIXQ14938 502 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PRUNE1Q86TP1 453 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC51AQ86UW1 340 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 IFT43Q96FT9 208 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CYLDQ9NQC7 956 aa21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 IL1R1P14778 569 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SESN3P58005 492 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP3CAQ08209 521 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RCN2Q14257 317 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF220Q5VTB9 566 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.038e-6■■■■□ 19.3
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 KCND2Q9NZV8 630 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NARFQ9UHQ1 456 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 BCS1LQ9Y276 419 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP26A1O43174 497 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF76P36508 570 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 UCMAQ8WVF2 138 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 DYDC2Q96IM9 177 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC25Q96NG3 672 aa21.5■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC22O60826 627 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ZWINTO95229 277 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 KRT15P19012 456 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 GCAP28676 217 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MAPK4P31152 587 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SHMT1P34896 483 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 GCLMP48507 274 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 HHATQ5VTY9 493 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 DCAF4Q8WV16 495 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 KAT5Q92993 513 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 AMNQ9BXJ7 453 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLITRK3O94933 977 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MYBL1P10243 752 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CA4P22748 312 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RCN1Q15293 331 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MIPEPQ99797 713 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.49■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 FGD4Q96M96 766 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 RAD21O60216 631 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP9AO75110 1047 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MFAP3P55082 362 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 BICD1Q96G01 975 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.48■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC1A1P43005 524 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNG2Q16589 344 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PPFIBP2Q8ND30 876 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC5A5Q92911 643 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 STRA6Q9BX79 667 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 NPHS2Q9NP85 383 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP3A4P08684 503 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 CYP11B1P15538 503 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC34A1Q06495 639 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SHC3Q92529 594 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 PPCSQ9HAB8 311 aa21.47■■□□□ 1.03
PPP1CC-201ENST00000335007 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms