RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PSMC5P62195 406 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CUL3Q13618 768 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 TCEAL1Q15170 157 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ATL2Q8NHH9 583 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SLC16A4O15374 487 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB7AO95365 584 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PEX3P56589 373 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 KRT76Q01546 638 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PHC3Q8NDX5 983 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 KRT35Q92764 455 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 TIPINQ9BVW5 301 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 RIPK3Q9Y572 518 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CHN1P15882 459 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CETN1Q12798 172 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 XKR9Q5GH70 373 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ALG6Q9Y672 507 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ARID2Q68CP9 1835 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MAPK13O15264 365 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MMEP08473 750 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SFNP31947 248 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 NCKAP1LP55160 1127 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MTMR3Q13615 1198 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 LLGL1Q15334 1064 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 KLHL29Q96CT2 875 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 USP20Q9Y2K6 914 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ADRB2P07550 413 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ALDH3A1P30838 453 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 BACE1P56817 501 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PMM2O15305 246 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 FDX1P10109 184 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CHRNB2P17787 502 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PCK1P35558 622 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MSH2P43246 934 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ITIH4Q14624 930 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PCDHB18PQ96TA0 734 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 NPTXRO95502 500 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 IMPDH2P12268 514 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 RFC5P40937 340 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MXI1P50539 228 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 DUPD1Q68J44 220 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PFASO15067 1338 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CCNG1P51959 295 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 DR1Q01658 176 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 MTA1Q13330 715 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PPP2R5EQ16537 467 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 DCAF15Q66K64 600 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 TEX9Q8N6V9 391 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 PNMA3Q9UL41 463 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SGPL1O95470 568 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 CCND2P30279 289 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 LONP2Q86WA8 852 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 C18orf8Q96DM3 657 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 BTBD6Q96KE9 485 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 IWS1Q96ST2 819 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 RAB17Q9H0T7 212 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SNX24Q9Y343 169 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS6-201ENST00000299238 SMAPO00193 183 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HPS6-201ENST00000299238 ADSSP30520 456 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms