RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	YET3	Q07451	203 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	GCN3	P14741	305 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PEX17	P40155	199 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ILM1	P47155	203 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	OSH6	Q02201	448 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YML108W	Q03759	105 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YPR011C	Q12251	326 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.4	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.39	□□□□□ -1.87	not detected
CMR3	YPR013C	SHG1	P38337	142 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	TEM1	P38987	245 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YER189W	P40104	122 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	POG1	P40473	351 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YJL028W	P47062	111 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YGL159W	P53110	370 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	RSM27	P53305	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	HAL1	Q01766	294 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PRM15	Q03262	622 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YDR248C	Q03786	193 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SLD7	Q08457	257 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YNG1	Q08465	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	MSA1	Q08471	629 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	GRE1	Q08969	168 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SWI1	P09547	1314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	CKA2	P19454	339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PCL1	P24867	279 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	OAC1	P32332	324 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	CAF4	P36130	643 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	MRPL28	P36527	147 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	BDH1	P39714	382 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	FAR7	P43592	221 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YJR056C	P47115	236 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	EMI1	Q04406	187 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	TIM22	Q12328	207 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	APS1	P35181	156 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ECM13	P38195	257 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SPL2	P38839	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SUR2	P38992	349 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	COG3	P40094	801 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	CAT5	P41735	233 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	COQ5	P49017	307 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PST1	Q12355	444 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ISD11	Q6Q560	94 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YAK1	P14680	807 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	CPT1	P17898	393 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ECM14	P38836	430 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ERV29	P53337	310 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YIP3	P53633	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	MRX8	Q05473	314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	INM2	Q05533	292 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	EMP46	Q12396	444 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PAN1	P32521	1480 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SFC1	P33303	322 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SRP14	P38985	146 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YFL012W	P43580	148 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YGR067C	P53243	804 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	GTR2	P53290	341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	SNO1	Q03144	224 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	TSA2	Q04120	196 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YLR462W	O13556	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	CUP2	P15315	225 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	UTH1	P36135	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YEL075C	P39972	122 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PRM8	P53174	237 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	RTC4	P53850	401 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YML096W	Q04489	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YPL264C	Q08980	353 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	MDM32	Q12171	622 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	PRR2	Q12310	699 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	AGC1	Q12482	902 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	YPL247C	Q12523	523 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CMR3	YPR013C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88

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