RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PAU17	Q12370	124 aa		6	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	HUT1	Q12520	339 aa		6	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		6	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MSW1	P04803	379 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SIR2	P06700	562 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YFL068W	P0CX99	160 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TFS1	P14306	219 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RPB5	P20434	215 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	FMT1	P32785	401 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MIC12	P38341	106 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	GET2	P40056	285 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YER158C	P40095	573 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YIL012W	P40551	113 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YIP5	P53108	310 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YGR079W	P53249	370 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	AAH1	P53909	347 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RCE1	Q03530	315 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MCH1	Q07376	486 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SHS1	Q07657	551 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TEN1	Q07921	160 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	AIM39	Q08223	395 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SIA1	Q12212	622 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YCT1	Q12235	531 aa		5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SOD2	P00447	233 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PAU19	P0CE85	124 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PAU21	P0CE86	164 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PAU22	P0CE87	164 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	NUP1	P20676	1076 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PAU3	P25610	124 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	UTR2	P32623	467 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	UPS2	P35200	230 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TRS20	P38334	175 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	HEM14	P40012	539 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RRG9	P40156	214 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	IME4	P41833	600 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	BUD9	P53226	547 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	NUP100	Q02629	959 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	ATG21	Q02887	496 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	UPS3	Q04006	179 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TMN2	Q04562	672 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PST1	Q12355	444 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PUT1	P09368	476 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TIR1	P10863	254 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PPH21	P23594	369 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	POP5	P28005	173 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	RML2	P32611	393 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MSN2	P33748	704 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TOS1	P38288	455 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	ERG28	P40030	148 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.97	□□□□□ -1.45	not detected
HMS2	YJR147W	RPA43	P46669	326 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	ZAP1	P47043	880 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YGR149W	P48236	432 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	EXG2	P52911	562 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MTL1	P53214	551 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YNL140C	P53910	189 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	PLB2	Q03674	706 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	COQ10	Q08058	207 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	TMS1	Q12116	473 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	ERP3	Q12403	225 aa		5.97	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
HMS2	YJR147W	MYO1	P08964	1928 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	CYC7	P00045	113 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	QCR7	P00128	127 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	HEM2	P05373	342 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	PHO2	P07269	559 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	ATP10	P18496	279 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	SEC22	P22214	214 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	ERG8	P24521	451 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HMS2	YJR147W	TY2A-C	P25383	438 aa		5.96	□□□□□ -1.46

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