RNA–Protein interactions for RNA: YER127W

LCP5, Essential protein involved in maturation of 18S rRNA, yeast

Gene LCP5, Length 1,074 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCP5	YER127W	MEC1	P38111	2368 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YCR099C	P25657	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	MRPL6	P32904	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TRM9	P49957	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	PEX30	Q06169	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TRM10	Q12400	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	RPB9	P27999	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	RIB7	P33312	244 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	CAB3	P36076	571 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	HOC1	P47124	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	MDM34	P53083	459 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	SML1	Q04964	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	CDC123	Q05791	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TFS1	P14306	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YIL086C	P40503	102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	IBA57	P47158	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YJR149W	P47177	404 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	HST4	P53688	370 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	FRM2	P37261	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TRR2	P38816	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	MRX5	P47007	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	BOL2	P53082	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	SLD7	Q08457	257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	CPT1	P17898	393 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	MRPL25	P23369	157 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	ADE1	P27616	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	AIM29	P36154	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	CPD1	P53314	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	DPP1	Q05521	289 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YHI9	P38765	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YIL012W	P40551	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	FMP33	P46998	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	IMP1	P28627	190 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YIR035C	P40579	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	MRS2	Q01926	470 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	AKR2	Q12013	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YCR102C	P25608	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	KRE29	P40026	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	APQ12	P40532	138 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	CDC8	P00572	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	CBF1	P17106	351 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YCR025C	P25352	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	FMT1	P32785	401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	RPN14	P53196	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	BOP2	Q06150	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	PST1	Q12355	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	STT4	P37297	1900 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	CUP2	P15315	225 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	CUP9	P41817	306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	MAL13	P53338	473 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	TPO4	Q12256	659 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
LCP5	YER127W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
LCP5	YER127W	PTM1	P32857	523 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	MRPL3	P36516	390 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	MBA1	P38300	278 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	GOT1	Q03554	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	VPH2	P32341	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	ETR1	P38071	380 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	AVT7	P40501	490 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	VPS60	Q03390	229 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	YML018C	Q03730	393 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	YET3	Q07451	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	SUA5	P32579	426 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LCP5	YER127W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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