RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 UBE3CQ15386 1083 aa5.7□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 TATDN1Q6P1N9 297 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 KCTD1Q719H9 257 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.7□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 KBTBD3Q8NAB2 608 aa5.7□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 CCL15Q16663 113 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 SH3RF2Q8TEC5 729 aa5.69□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 GAS7O60861 476 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 HIP1RO75146 1068 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 PFKLP17858 780 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 GJA4P35212 333 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 SCNN1BP51168 640 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 EPHA5P54756 1037 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 ANKRD45Q5TZF3 282 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 SLC44A5Q8NCS7 719 aa5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 RNF38Q9H0F5 515 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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PRPF8-211ENST00000574728 KCNK12Q9HB15 430 aa5.68□□□□□ -1.5
PRPF8-211ENST00000574728 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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