RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	STAM	Q92783	540 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	BICD1	Q96G01	975 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	EPSTI1	Q96J88	318 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	REEP2	Q9BRK0	252 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PARVG	Q9HBI0	331 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMYND10	O75800	440 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FGFR3	P22607	806 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	LIG4	P49917	911 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF131	P52739	623 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	MCL1	Q07820	350 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SEZ6	Q53EL9	994 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNN1	Q92952	543 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX27	Q96L92	541 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNH6	Q9H252	994 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.27	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479		I3L4J1	428 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479		K7ENM7	598 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PODXL	O00592	558 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	STX6	O43752	255 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ASGR2	P07307	311 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CLTA	P09496	248 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCD1	P33897	745 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1D2	P34982	312 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G5	P39877	138 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TXLNA	P40222	546 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	BRCC3	P46736	316 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB33A	Q14088	237 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	KYAT1	Q16773	422 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	LIN9	Q5TKA1	542 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	USP49	Q70CQ1	688 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX21	Q969T3	373 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ASIC4	Q96FT7	647 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CLIC6	Q96NY7	704 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.26	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM12	O43184	909 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PAPLN	O95428	1278 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PIGR	P01833	764 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2B	Q00403	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC39A14	Q15043	492 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXL6	Q8N531	539 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNK12	Q9HB15	430 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	MTRR	Q9UBK8	725 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	CLUH	O75153	1309 aa		10.25	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.24	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.24	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479		H7C4K7	107 aa		10.24	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	SYN3	O14994	580 aa		10.24	□□□□□ -0.77
KIFC3-231	ENST00000567479	OGT	O15294	1046 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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