RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 MTRRQ9UBK8 725 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 C5orf42Q9H799 3197 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 H3BQV1 296 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ZNF197O14709 1029 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 B4GALT5O43286 388 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 LRP3O75074 770 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 KIF4AO95239 1232 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PTPN2P17706 415 aa7.55□□□□□ -1.2
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CS-233ENST00000552688 RARRES1P49788 294 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 NTHL1P78549 312 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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CS-233ENST00000552688 MAPK6Q16659 721 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 POTEDQ86YR6 584 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 MCPH1Q8NEM0 835 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ZNF461Q8TAF7 563 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ITFG1Q8TB96 612 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 RABGGTAQ92696 567 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 UROC1Q96N76 676 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 KXD1Q9BQD3 176 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 RAB23Q9ULC3 237 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 MAFFQ9ULX9 164 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ACKR2O00590 384 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PTGESO14684 152 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 RECQL4O94761 1208 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 B3GAT3O94766 335 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 LRG1P02750 347 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 RHOP08100 348 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CD72P21854 359 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TGM1P22735 817 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ELF1P32519 619 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 FZD5Q13467 585 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 NAB2Q15742 525 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CALCRLQ16602 461 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 LAIR1Q6GTX8 287 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 LEMD2Q8NC56 503 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 NETO1Q8TDF5 533 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 HASPINQ8TF76 798 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 IRF7Q92985 503 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TNFRSF25Q93038 417 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 SNX21Q969T3 373 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 SNTG2Q9NY99 539 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 USP18Q9UMW8 372 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CDY1Q9Y6F8 540 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 H7C4K7 107 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 ADAM12O43184 909 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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CS-233ENST00000552688 RETP07949 1114 aa7.53□□□□□ -1.2
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CS-233ENST00000552688 EFNA5P52803 228 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 MTAPQ13126 283 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PKP1Q13835 747 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 PPP2R5AQ15172 486 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-233ENST00000552688 IQCEQ6IPM2 695 aa7.53□□□□□ -1.2
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