RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 S1PR5Q9H228 398 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RNF19AQ9NV58 838 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NR2E1Q9Y466 385 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 FSD2A1L4K1 749 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.6□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 EOMESO95936 686 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ASGR2P07307 311 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DDIT3P35638 169 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NAMPTP43490 491 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SKOR1P84550 965 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MAPK7Q13164 816 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PPP2R5AQ15172 486 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TMEM259Q4ZIN3 620 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ARSHQ5FYA8 562 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 UBXN11Q5T124 520 aa10.6□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ANKRD54Q6NXT1 300 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 GPBP1Q86WP2 473 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DAW1Q8N136 415 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 HELQQ8TDG4 1101 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RAD54LQ92698 747 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CASD1Q96PB1 797 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 HINFPQ9BQA5 517 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SPTBN2O15020 2390 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 K7ERI5 159 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SLC16A4O15374 487 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 YEATS4O95619 227 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 AXLP30530 894 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TXLNAP40222 546 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 ERVFC1P60507 584 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KCNA1Q09470 495 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ANGPT1Q15389 498 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MAPK6Q16659 721 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 PLPP4Q5VZY2 271 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NOTUMQ6P988 496 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ABI1Q8IZP0 508 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PDILTQ8N807 584 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DRC1Q96MC2 740 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 POMKQ9H5K3 350 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CFAP45Q9UL16 551 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 HES2Q9Y543 173 aa10.59□□□□□ -0.71
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CS-217ENST00000550044 A0A087X0B3 334 aa10.58□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 HOXA2O43364 376 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 PI15O43692 258 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 CUTAO60888 179 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 ZNF623O75123 536 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 FGF18O76093 207 aa10.58□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 SKIP12755 728 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 GUCY2CP25092 1073 aa10.58□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
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CS-217ENST00000550044 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.726e-13■□□□□ 9.5
CS-217ENST00000550044 ATL3Q6DD88 541 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 AGMOQ6ZNB7 445 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 DYMQ7RTS9 669 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-217ENST00000550044 CCDC105Q8IYK2 499 aa10.58□□□□□ -0.72
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