RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 HDAC10Q969S8 669 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 DRGXA6NNA5 263 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 MYBL2P10244 700 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.414e-19■□□□□ 9.8
RBM39-241ENST00000496183 CHN2P52757 468 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 KRT85P78386 507 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 MED25Q71SY5 747 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RSPH3Q86UC2 560 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 PPM1NQ8N819 430 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SOGA1O94964 1423 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SYNJ1O43426 1573 aa6.23□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.413e-13■■■■■ 51.5
RBM39-241ENST00000496183 FOXN1O15353 648 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 NDUFA10O95299 355 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 MT-CO1P00395 513 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 NR4A1P22736 598 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CCND1P24385 295 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ALDH1A3P47895 512 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 INHBEP58166 350 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ZNF529Q6P280 563 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 SYT12Q8IV01 421 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 TDP1Q9NUW8 608 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 RNF181Q9P0P0 153 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 INTUQ9ULD6 942 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 CHD1O14646 1710 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 GRIN2BQ13224 1484 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.22□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.21□□□□□ -1.41
RBM39-241ENST00000496183 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 NDUFS2O75306 463 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 DDCP20711 480 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 WASP42768 502 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 FSTL1Q12841 308 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ZNF627Q7L945 461 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 NRG4Q8WWG1 115 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 STON2Q8WXE9 905 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MLST8Q9BVC4 326 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 LDAHQ9H6V9 325 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PPFIA2O75334 1257 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CDKL5O76039 1030 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 GCP02774 474 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CDC42EP1Q00587 391 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 INAVAQ3KP66 663 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 FITM2Q8N6M3 262 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SYNJ2O15056 1496 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 ZNF185O15231 689 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 SGTAO43765 313 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 CFIP05156 583 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 FAM189BP81408 668 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MTM1Q13496 603 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-241ENST00000496183 MTMR1Q13613 665 aa6.19□□□□□ -1.42
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