RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SPSB2Q99619 263 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 EDEM2Q9BV94 578 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 AZI2Q9H6S1 392 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 JADE2Q9NQC1 790 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 VPS45Q9NRW7 570 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MARCH5Q9NX47 278 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SLC9A2Q9UBY0 812 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 LNP1A1A4G5 178 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SMCO2A6NFE2 343 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 M0R2N6 131 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGAP6O43182 974 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TGM5O43548 720 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ECI2O75521 394 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 OFD1O75665 1012 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZMYND10O75800 440 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SOD2P04179 222 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ADH1AP07327 375 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 STAT5BP51692 787 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ACTR2P61160 394 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PTGDRQ13258 359 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CEP68Q76N32 757 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF843Q8N446 348 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 RNF169Q8NCN4 708 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 DEFB124Q8NES8 71 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GAB3Q8WWW8 586 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MBOAT7Q96N66 472 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PIDD1Q9HB75 910 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NUP205Q92621 2012 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MAN2B1O00754 1011 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 C2CD2LO14523 706 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MAFGO15525 162 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 EDIL3O43854 480 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 VTNP04004 478 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ATP4AP20648 1035 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 FCARP24071 287 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 GMPRP36959 345 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 ADCY7P51828 1080 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 Q6ZS52 159 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 DNASE1L2Q92874 299 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 LPPQ93052 612 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 PGBD1Q96JS3 809 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 SDF4Q9BRK5 362 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 CHST7Q9NS84 486 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 DPP7Q9UHL4 492 aa8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C9orf135-204ENST00000495399 TCHHQ07283 1943 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CARNS1A5YM72 827 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 BACH1O14867 736 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ATG7O95352 703 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 C22orf31O95567 290 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GJB2P29033 226 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PHKA2P46019 1235 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 NLRP5P59047 1200 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DSG1Q02413 1049 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PLK5Q496M5 336 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.33□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms