RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493315.1

WDPCP-217, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDPCP, Length 1,476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-217ENST00000493315 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.38□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 NAGPAQ9UK23 515 aa8.38□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 INTUQ9ULD6 942 aa8.38□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.38□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 COL1A2P08123 1366 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CLDN3O15551 220 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ASAP2O43150 1006 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 LGALS2P05162 132 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 KLRC1P26715 233 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ACOT2P49753 483 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 IGBP1P78318 339 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 BIRC3Q13489 604 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 WDR44Q5JSH3 913 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CCDC181Q5TID7 509 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZPBP2Q6X784 338 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 METTL13Q8N6R0 699 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 RNF149Q8NC42 400 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 MAML3Q96JK9 1138 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 NLRP4Q96MN2 994 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CGRRF1Q99675 332 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TCHPQ9BT92 498 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 GPR88Q9GZN0 384 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 SNX12Q9UMY4 172 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 USP20Q9Y2K6 914 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.37□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 MAGEB2O15479 319 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TOM1L1O75674 476 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PALMO75781 387 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TMOD1P28289 359 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PAFAH1B1P43034 410 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PDE6CP51160 858 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 MMP16P51512 607 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 DRP2Q13474 957 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 SURF1Q15526 300 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 SV2AQ7L0J3 742 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 AFG1LQ8WV93 481 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TAF4BQ92750 862 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 AGPAT1Q99943 283 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TINF2Q9BSI4 451 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.076e-14■■■■■ 335.4
WDPCP-217ENST00000493315 CPA4Q9UI42 421 aa8.36□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 NCANO14594 1321 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 A0A0B4J269 797 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 OGTO15294 1046 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 SRGAP2O75044 1071 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PHACTR2O75167 634 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 HLA-DRAP01903 254 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF286BP0CG31 522 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 KRT5P13647 590 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 INSRRP14616 1297 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PRLRP16471 622 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 PHKA2P46019 1235 aa8.35□□□□□ -1.07
WDPCP-217ENST00000493315 CLCN3P51790 818 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms