RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 GSE1Q14687 1217 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 MAN2A1Q16706 1144 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 FILIP1LQ4L180 1135 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB33Q86T24 672 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 IRF2BP1Q8IU81 584 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 BRSK2Q8IWQ3 736 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TRIM59Q8IWR1 403 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 THNSL1Q8IYQ7 743 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 BORCS6Q96GS4 357 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 FNBP1Q96RU3 617 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 HAPLN2Q9GZV7 340 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 IPPQ9Y573 584 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TRANK1O15050 2925 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SCN5AQ14524 2016 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 FSD2A1L4K1 749 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 C9IYK1 514 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ENPP3O14638 875 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 P4HA2O15460 535 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CBFA2T2O43439 604 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 XPOTO43592 962 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF15O94989 841 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ITGA4P13612 1032 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CASP4P49662 377 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 VAMP7P51809 220 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CYP24A1Q07973 514 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SARM1Q6SZW1 724 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 RNF214Q8ND24 703 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 PARD3BQ8TEW8 1205 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SAAL1Q96ER3 474 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TMEM161AQ9NX61 479 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 COG5Q9UP83 839 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 USP20Q9Y2K6 914 aa12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TTC26A0AVF1 554 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 INPPL1O15357 1258 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ACOT2P49753 483 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 MRE11P49959 708 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TAP1Q03518 808 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CETN1Q12798 172 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 XKR4Q5GH76 650 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SPRED2Q7Z698 418 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ECHDC2Q86YB7 292 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 WDR49Q8IV35 697 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 RDH13Q8NBN7 331 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 HLA-CQ95604 372 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CNTN3Q9P232 1028 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 C2CD2Q9Y426 696 aa12.68□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CARNS1A5YM72 827 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8IPA6NC78 632 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA8JA6NMD2 632 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 PI4K2BG5E9Z4 385 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 MGEA5O60502 916 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SERPINC1P01008 464 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 KCNE1P15382 129 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 PAX3P23760 479 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 KRT31Q15323 416 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 VWA3BQ502W6 1294 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ALKAL1Q6UXT8 129 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SLC35C1Q96A29 364 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SLC9A7Q96T83 725 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CGRRF1Q99675 332 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 NDST4Q9H3R1 872 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SNTG2Q9NY99 539 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 KANSL3Q9P2N6 904 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 PARP2Q9UGN5 583 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 RECQL4O94761 1208 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 AFPP02771 609 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 AMHP03971 560 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 CYP3A5P20815 502 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 TNFSF9P41273 254 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 COPB1P53618 953 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 UBASH3AP57075 661 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 FANCCQ00597 558 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 DUOXA2Q1HG44 320 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 SLC10A6Q3KNW5 377 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-211ENST00000488243 FKBP15Q5T1M5 1219 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms