RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF276Q8N554 614 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 IFI44Q8TCB0 444 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 DKK2Q9UBU2 259 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 FZD1Q9UP38 647 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.32□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF202O95125 648 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CCND1P24385 295 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CTXN1P60606 82 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 FAM189BP81408 668 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 IL10RAQ13651 578 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MYOCQ99972 504 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 POGKQ9P215 609 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.31□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MARCH11A6NNE9 402 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF185O15231 689 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CHN2P52757 468 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 DSC2Q02487 901 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MRGPREQ86SM8 312 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 PRR18Q8N4B5 295 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 TDP1Q9NUW8 608 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 GAGE12BA1L429 117 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CYR61O00622 381 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ALDH1L1O75891 902 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ABLIM3O94929 683 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 POMCP01189 267 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MCL1Q07820 350 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZNF529Q6P280 563 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 AMER2Q8N7J2 671 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 TEX101Q9BY14 249 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 ITGB1P05556 798 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 MAKP20794 623 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 GCSHP23434 173 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 PTGS2P35354 604 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 RAP2BP61225 183 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 RAB39AQ14964 217 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 HAS1Q92839 578 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2I-208ENST00000482232 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PPFIA4O75335 1185 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FSHBP01225 129 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 MCM7P33993 719 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 GDF5P43026 501 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 TLE1Q04724 770 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ABHD18Q0P651 414 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 MED25Q71SY5 747 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 MIER2Q8N344 545 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 KAT5Q92993 513 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 HOOK2Q96ED9 719 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 TMX3Q96JJ7 454 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 CHD1O14646 1710 aa7.27□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 RPS6KA4O75676 772 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 NCR1O76036 304 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 POU2F2P09086 479 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 ALAS1P13196 640 aa7.26□□□□□ -1.25
GTF2I-208ENST00000482232 BMPR1AP36894 532 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms