RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 LRRN2O75325 713 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 RPS6KA5O75582 802 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PHKA2P46019 1235 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MFAP3P55082 362 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TNNC1P63316 161 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MS4A14Q96JA4 679 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 NT5C1BQ96P26 610 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TCHPQ9BT92 498 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GJD2Q9UKL4 321 aa20.51■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 RNF40O75150 1001 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GJB1P08034 283 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TNNI1P19237 187 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MCL1Q07820 350 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PPFIA1Q13136 1202 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZNF516Q92618 1163 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 FAM81BQ96LP2 452 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 NCANO14594 1321 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TMEM253P0C7T8 217 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CYP2B6P20813 491 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GRIK4Q16099 956 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZACNQ401N2 412 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CGRRF1Q99675 332 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 EHD2Q9NZN4 543 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.5■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 AGPSO00116 658 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ABLIM1O14639 778 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 OGTO15294 1046 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CA12O43570 354 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 FAM189A1O60320 539 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PROZP22891 400 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GYS2P54840 703 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PAK2Q13177 524 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GRM1Q13255 1194 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CCL14Q16627 93 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 FAM187BQ17R55 369 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 EVPLQ92817 2033 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.49■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ERICH4A6NGS2 130 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 IGHA2P01877 340 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ACTN2P35609 894 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 LMAN1P49257 510 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 WNT7BP56706 349 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TLK2Q86UE8 772 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 MREGQ8N565 214 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 HELQQ8TDG4 1101 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SH3GL2Q99962 352 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 AKT3Q9Y243 479 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 OPA1O60313 960 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GGCXP38435 758 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 AP3M2P53677 418 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SLC7A5Q01650 507 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SURF1Q15526 300 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB33Q86T24 672 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 SHC3Q92529 594 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 Q9Y3F1 56 aa20.48■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 CCDC188H7C350 402 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 KCNK3O14649 394 aa20.47■□□□□ 0.87
SYF2-204ENST00000476231 F2P00734 622 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms