RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466373.1

UFD1-206, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 2

Gene UFD1, Length 3,059 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-206	ENST00000466373	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	EMC2	Q15006	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CLUL1	Q15846	466 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	KAT2B	Q92831	832 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ACSL3	O95573	720 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ECEL1	O95672	775 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	WDR44	Q5JSH3	913 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	UST	Q9Y2C2	406 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ATP4A	P20648	1035 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	DSG3	P32926	999 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	GCNT1	Q02742	428 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	KRT17	Q04695	432 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	STRN3	Q13033	797 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	RDM1	Q8NG50	284 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	EXTL3	O43909	919 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ATP2C2	O75185	946 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CHN1	P15882	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CEP89	Q96ST8	783 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373		H0YHG0	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	MAFG	O15525	162 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	GGPS1	O95749	300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	EDN1	P05305	212 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	NUDT17	P0C025	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	GART	P22102	1010 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	GTF2H1	P32780	548 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	TLCD1	Q96CP7	247 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ACAD9	Q9H845	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373		K7ERI5	159 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	RIPK2	O43353	540 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	VNN1	O95497	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	IFNAR2	P48551	515 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-206	ENST00000466373	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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