RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 PDLIM7Q9NR12 457 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 VGLL3A8MV65 326 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 FSCN2O14926 492 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CHN1P15882 459 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CEP89Q96ST8 783 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.87■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ACOT2P49753 483 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ASIC3Q9UHC3 531 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 EXTL3O43909 919 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 FSBPO95073 299 aa21.86■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 RTP1P59025 263 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CHST7Q9NS84 486 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 HACL1Q9UJ83 578 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 MYPNQ86TC9 1320 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 MMP13P45452 471 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 STRN3Q13033 797 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.85■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 FZD1Q9UP38 647 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 RASGRF2O14827 1237 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 AGTP01019 485 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 HLA-DRAP01903 254 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 REPS2Q8NFH8 660 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 TMEM143Q96AN5 459 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 FAM81BQ96LP2 452 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.85■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.84■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 TMEM132BQ14DG7 1078 aa21.84■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 SLCO2A1Q92959 643 aa21.83■■□□□ 1.09
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IMP4-208ENST00000460766 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 PIM2Q9P1W9 311 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 NFASCO94856 1347 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-208ENST00000460766 ACSL3O95573 720 aa21.83■■□□□ 1.08
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