RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FGFR3P22607 806 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BRCC3P46736 316 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MCL1Q07820 350 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PSMD5Q16401 504 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM130Q8N3G9 435 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KCNN1Q92952 543 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SNX21Q969T3 373 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CNTN3Q9P232 1028 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LIMD1Q9UGP4 676 aa17.84■□□□□ 0.45
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLDN3O15551 220 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PAPLNO95428 1278 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 C1RP00736 705 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ASGR2P07307 311 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 KREMEN2Q8NCW0 462 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HDAC7Q8WUI4 952 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 UROC1Q96N76 676 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SMOC2Q9H3U7 446 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZHX3Q9H4I2 956 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PARVGQ9HBI0 331 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBX20Q9UMR3 447 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 USTQ9Y2C2 406 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZNF318Q5VUA4 2279 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 H0YCG3 227 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 K7ENM7 598 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TRAK2O60296 914 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TKTP29401 623 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CREMQ03060 361 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SIGLEC14Q08ET2 396 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC39A14Q15043 492 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC149Q6ZUS6 474 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ASIC4Q96FT7 647 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BICD1Q96G01 975 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC38A7Q9NVC3 462 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DPP7Q9UHL4 492 aa17.82■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PODXLO00592 558 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CXCL8P10145 99 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TNFSF9P41273 254 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.448e-6■□□□□ 8.9
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SPAG1Q07617 926 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RRAGBQ5VZM2 374 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DYMQ7RTS9 669 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PANK2Q9BZ23 570 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FBXW11Q9UKB1 542 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 A0A087X0B3 334 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYMKA6NI61 221 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 FAM189A1O60320 539 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZMYND10O75800 440 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PIGRP01833 764 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 OR1D2P34982 312 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 NASPP49321 788 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 LIG4P49917 911 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GTF2BQ00403 316 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CYP26C1Q6V0L0 522 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PLCD3Q8N3E9 789 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PBXIP1Q96AQ6 731 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 PRKD2Q9BZL6 878 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MTRRQ9UBK8 725 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 WDFY4Q6ZS81 3184 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MYH15Q9Y2K3 1946 aa17.8■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 DOCK8Q8NF50 2099 aa17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 MUC6Q6W4X9 2439 aa17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TTC26A0AVF1 554 aa17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANKRD63C9JTQ0 380 aa17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CLTAP09496 248 aa17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RPL9P32969 192 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RAB33AQ14088 237 aa17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms