RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MOCOSQ96EN8 888 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GALT6Q96L58 329 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNF1BP35680 557 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 P2RY2P41231 377 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFMP43652 599 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRNQ16849 979 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OSBP2Q969R2 916 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPY2A6NKD2 308 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF197O14709 1029 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHGBP05060 677 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF883P0CG24 379 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNHG28P0DPA3 235 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN2P17706 415 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO1EQ12965 1108 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7ENP7 123 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JUPP14923 745 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCTP40126 519 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LONRF3Q496Y0 759 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPACA7Q96KW9 195 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEMA3CQ99985 751 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNFSF14O43557 240 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF623O75123 536 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EGFP01133 1207 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VTNP04004 478 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO43Q4G163 708 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AZI2Q9H6S1 392 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNA2P16389 499 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR1G1P47890 313 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGFBP7Q16270 282 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANO7Q6IWH7 933 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FUT10Q6P4F1 479 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMP21Q8N119 569 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL1A2P08123 1366 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANO9A1A5B4 782 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLRT2O43155 660 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TDO2P48775 406 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00303Q3SY05 128 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNTG2Q9NY99 539 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PQD8 194 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFTPCP11686 197 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DRD1P21728 446 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCR2P41597 374 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAB27AP51159 221 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLA2Q14181 598 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPAQ15257 358 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RLN3Q8WXF3 142 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGBD4Q96DM1 585 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPVLQ9H3G5 476 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ESYT2A0FGR8 921 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F8W810 466 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRG1P02750 347 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C8BP07358 591 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms