RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428527.1

TTC27-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

TSL 3

Gene TTC27, Length 687 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-202ENST00000428527 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.31□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.31□□□□□ -1.24
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TTC27-202ENST00000428527 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.3□□□□□ -1.24
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TTC27-202ENST00000428527 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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TTC27-202ENST00000428527 PTPN21Q16825 1174 aa7.28□□□□□ -1.24
TTC27-202ENST00000428527 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.28□□□□□ -1.24
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TTC27-202ENST00000428527 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.28□□□□□ -1.24
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TTC27-202ENST00000428527 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC27-202ENST00000428527 IPPQ9Y573 584 aa7.25□□□□□ -1.25
TTC27-202ENST00000428527 CDHR4A6H8M9 788 aa7.24□□□□□ -1.25
TTC27-202ENST00000428527 CDKL5O76039 1030 aa7.24□□□□□ -1.25
TTC27-202ENST00000428527 SPDEFO95238 335 aa7.24□□□□□ -1.25
TTC27-202ENST00000428527 GCP02774 474 aa7.24□□□□□ -1.25
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