RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP6R2	O75170	966 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TOM1L1	O75674	476 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RFPL2	O75678	378 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CXCL14	O95715	111 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PIGR	P01833	764 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TXLNA	P40222	546 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62	9e-7	■■■■■ 26.8
HDLBP-216	ENST00000428482	LIG4	P49917	911 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	DSG1	Q02413	1049 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	STRN3	Q13033	797 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	XKR4	Q5GH76	650 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		11.18	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62	1e-6	■■■■■ 78.1
HDLBP-216	ENST00000428482	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TH	P07101	528 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	IDE	P14735	1019 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KRT85	P78386	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CASP10	Q92851	521 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SAAL1	Q96ER3	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	STRA6	Q9BX79	667 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	COL4A2	P08572	1712 aa		11.17	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PTPRJ	Q12913	1337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CUTA	O60888	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	GCNT3	O95395	438 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PFKFB1	P16118	471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ADSS	P30520	456 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ME1	P48163	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ACOT2	P49753	483 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CDR1	P51861	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ASIC1	P78348	528 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	GTF2B	Q00403	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PSMD5	Q16401	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	UPP1	Q16831	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	GJD3	Q8N144	294 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.16	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PTPRD	P23468	1912 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TGM5	O43548	720 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ALDH2	P05091	517 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNE1	P15382	129 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KLRC2	P26717	231 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	HOXD13	P35453	343 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SMTN	P53814	917 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CUL4B	Q13620	913 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms