RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM13A	O94988	1023 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	KCNE1	P15382	129 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CLIC6	Q96NY7	704 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CNTN3	Q9P232	1028 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CLDN3	O15551	220 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	RFPL2	O75678	378 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	MCL1	Q07820	350 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	PSMD5	Q16401	504 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	SEZ6	Q53EL9	994 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	SCP2	P22307	547 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	FGFR3	P22607	806 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	PDXDC1	Q6P996	788 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	USP28	Q96RU2	1077 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	TBX20	Q9UMR3	447 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	TMEM221	A6NGB7	291 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484		M0R296	226 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	TRAK2	O60296	914 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	PAPLN	O95428	1278 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC39A14	Q15043	492 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	BICD1	Q96G01	975 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484		K7ENM7	598 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	STK17A	Q9UEE5	414 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		32.45	■■■□□ 2.79
CIZ1-209	ENST00000420484	TRAPPC3	O43617	180 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	FIZ1	Q96SL8	496 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484		I3L4J1	428 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	PODXL	O00592	558 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ADAM12	O43184	909 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	PIGR	P01833	764 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	BRCC3	P46736	316 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	LIG4	P49917	911 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ZMYND10	O75800	440 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	CLTA	P09496	248 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	TXLNA	P40222	546 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ASGR2	P07307	311 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	CXCL8	P10145	99 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	GTF2B	Q00403	316 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ASIC4	Q96FT7	647 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	MTRR	Q9UBK8	725 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	OR1D2	P34982	312 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	MTMR3	Q13615	1198 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	DYM	Q7RTS9	669 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	PIDD1	Q9HB75	910 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	TTC26	A0AVF1	554 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	FAM189A1	O60320	539 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ABCD1	P33897	745 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	TNFSF9	P41273	254 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	RAB33A	Q14088	237 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	KYAT1	Q16773	422 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	HSCB	Q8IWL3	235 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CIZ1-209	ENST00000420484	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		32.39	■■■□□ 2.78

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