RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 GCNT1Q02742 428 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 CPXCR1Q8N123 301 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 DCLK3Q9C098 648 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.12■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SNX3O60493 162 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TTC4O95801 387 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ASNSP08243 561 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SFNP31947 248 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 VSTM1Q6UX27 236 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ANO5Q75V66 913 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TMEM120BA0PK00 339 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 CREB1P16220 341 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ITGA8P53708 1063 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 USP37Q86T82 979 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MYPNQ86TC9 1320 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 RAD17O75943 681 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 RRM1P23921 792 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ATP5DP30049 168 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SLC1A1P43005 524 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 KRT76Q01546 638 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 LRRC14Q15048 493 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 WLSQ5T9L3 541 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 FAM81BQ96LP2 452 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 GAS8O95995 478 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 CAV1Q03135 178 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 DYDC1Q8WWB3 177 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ARID2Q68CP9 1835 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 PLSCR1O15162 318 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MYBL1P10243 752 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MAP2K2P36507 400 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ENPEPQ07075 957 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 KYNUQ16719 465 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 GPD1LQ8N335 351 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 OGFOD1Q8N543 542 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MGARPQ8TDB4 240 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.09■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SORBS3O60504 671 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TCEA3O75764 348 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ATF2P15336 505 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SOX10P56693 466 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 FAM83AQ86UY5 434 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ATL2Q8NHH9 583 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TRIM11Q96F44 468 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 FAM84AQ96KN4 292 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.08■□□□□ 0.81
CBX1-202ENST00000393408 MAP3K10Q02779 954 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 CENPCQ03188 943 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 PTP4A2Q12974 167 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 ZNF677Q86XU0 584 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 CCDC63Q8NA47 563 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 SCLT1Q96NL6 688 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.08■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CBX1-202ENST00000393408 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms